Pour commencer le Real a doit faire face à de nombreuses incorporations :
-Le 25 juillet 2006, Fabio Cannavaro, récent champion du monde avec l'Italie, considéré comme l'un des meilleurs défenseurs centraux au monde et provenant du même club que le nouvel entraîneur (Juventus Turin) - Il sera élu ballon d'or france football 2006 le 28 novembre 2006.
-Le 26 juillet 2006, Emerson, milieu défensif brésilien arrive à son tour toujours de la Juventus Turin.
-Le 28 juillet 2006, Fabio Capello fait venir l'un de ses attaquants préférés, Ruud van Nistelrooy qui quitte les Red Devils après y être tombé en disgrâce.
Enfin, le Real Madrid ajoute deux recrues de choix dans les dernières semaines de la période des tranferts:
-Le 20 août 2006, le club, après une rude bataille avec ses homologues de l'Olympique lyonnais, parvient à faire signer le milieu défensif malien, Mahamadou Diarra, considéré comme la recrue « numéro 1 » du Real Madrid par son nouvel entraîneur.
-Enfin, le 31 août 2006, les merengues concluent un dernier transfert en parvenant à échanger pour une durée d'un an avec option d'échange définitif, leur milieu offensif Júlio Baptista (arrivé du FC Séville la saison passée) contre l'espagnol, José Antonio Reyes qui souhaitait rentrer au pays.
Pourtant la saison semble bien commencer pour le club puisque le 23 août 2006, il remporte son premier trophée, le trophée amical Santiago Bernabéu, aux dépens du club belge d'Anderlecht grâce notamment à deux buts de Ruud van Nistelrooy. Néanmoins, même si le club débute plutôt bien le championnat en figurant parmi le trio de tête après les 5 premières journées, il montre toujours des carences sur la scène européenne avec une nouvelle défaite contre l'Olympique lyonnais (2-0) sur un score qui aurait pu se montrer bien plus large. En octobre-novembre, le bilan de la nouvelle saison semble bien avec une bonne équipe, une grande victoire sur le Barca ... Mais en hiver, les doutes s'installent après des défaites à domiciles contre Levante, le Celta Vigo, et le Recreativo Huelva.
Au premier mercato d'hiver sous la présidence Calderón, le recrutement se veut rajeuni et audacieux. Ainsi ont signé :
-le 16 novembre 2006 : Marcelo, défenseur latéral gauche brésilien qui tentera de faire oublier son idole Roberto Carlos, une fois que ce dernier sera parti du club (il partira en juin 2007 au Fenerbahce),
-le 20 décembre 2006 : Gonzalo Higuaín, jeune attaquant franco-argentin de 19 ans en provenance de River Plate. Ce joueur prometteur a été pré-sélectionné en équipes nationales par la France et l'Argentine mais a finalement choisi l'Albiceleste,
-le 22 décembre 2006 : Fernando Gago, milieu défensif italo-argentin (international argentin) de Boca Juniors de 20 ans. On dit de lui qu'il est le nouveau Fernando Redondo, que les socios n'ont jamais oublié.
L'arrivée de Fabio Capello ne suffit néanmoins pas à améliorer de façon notable les résultats du club. Fin 2006 et début 2007, il n'hésite plus à écarter des cadres de l'équipe dont ceux qui sont arrivés au club à l'été 2006 :
-Le 11 janvier 2007, la superstar anglaise David Beckham annonce son départ du club à l'été 2007 à la fin de son contrat pour le club du Los Angeles Galaxy moyennant un salaire annuel estimé à 38 millions d'euros. Capello annonce même le jour suivant qu'il a décidé de ne plus avoir recours à Beckham jusqu'à la fin de son contrat.
-D'autres joueurs sont considérés comme indésirables par le technicien italien : Ronaldo, le Brésilien, meilleur buteur de l'histoire de la Coupe du Monde depuis 2006 ainsi qu'Antonio Cassano, l'Italien, arrivé seulement l'année passée, sont priés d'aller voir ailleurs car ils n'entrent pas dans le schéma tactique de l'équipe (on peut supposer que le comportement jugé irrespectueux de Cassano envers Capello y est aussi pour quelque chose).
-Enfin, des membres de l'équipe sont fortement critiqués et notamment les nouvelles recrues de l'été qui sont jugées inefficaces par Capello : le club envisage le recrutement d'un défenseur central supplémentaire pour pallier le manque d'efficacité du défenseur central italien Fabio Cannavaro, Ballon d'or 2006 et élu meilleur joueur FIFA de l'année 2006 («Il joue mal et ne gagne plus aucun ballon » dit de lui son entraîneur). La paire de milieux de terrain recrutée à l'été, à savoir le Brésilien Emerson et le Malien Mahamadou Diarra, sont eux aussi critiqués. Seul Ruud van Nistelrooy semble donner satisfaction à l'entraîneur.
Certes les recrues n'ont pas donné l'efficacité attendue et le club est en pleine reconstruction, néanmoins Fabio Capello apparaît dépassé et il se murmure déjà de nombreuses rumeurs sur son éventuel remplacement à l'été (le nom de José Mourinho, entraineur de Chelsea, est lancé comme rumeur).
A la surprise générale de tous : direction, supporters et médias, le célèbre clásico qui devait matérialiser l'échec des tactiques italiennes, a démontré que Fabio Capello était bel et bien l'homme de la situation. Le Real Madrid, nouvelle version rajeunie, a failli humilier le Barça au Camp Nou devant les dizaines de milliers de Catalans qui ont assisté au choc. Ce n'est que grâce au jeune prodige argentin, Lionel Messi, auteur d'un triplé extraordinaire, que le Barça a pu décrocher le nul (3-3) dans les derniers instants du match. Depuis lors, le Real n'a cessé d'impressionner tout le monde. A la veille de la 33ème journée, il occupe la troisième place à deux longueurs du Barça, leader actuel qui souffre, et à une seule du FC Séville après s'être imposé face au Nàstic Tarragona (2-0), au Celta Vigo (2-1), à Osasuna (2-0), face à Valence (2-1) et à San Mamés face à Bilbao (4-1). Seule une défaite injuste, marquée par de flagrantes erreurs d'arbitrage, contre le Racing Santander (1-2) risquait de nuire aux efforts de l'équipe. Après sa victoire lors de la 33ème journée face au FC Seville (qui était alors classé deuxième) sur le score de 3-2 (avec notamment un doublé de van Nistelrooy), le club madrilène semble plus que jamais en position de force pour mettre la pression sur le FC Barcelone, premier au classement. Aujourd'hui, le club est co-leader avec Barcelone, les deux clubs ayant 66 points chacun, mais le Real est considéré premier par la règle des confrontations directes en vigueur dans la Liga, le Real ayant battu Barcelone au match aller (2-0) et fait match nul (3-3) au match retour au Camp Nou. Lors de la 35ème journée de la Liga, le Real Madrid est difficilement venu à bout du Recreativo de Huelva. C'est en effet grâce au brésilien Roberto Carlos que le Real est parvenu à conserver sa place de leader grâce à un but à la dernière minute. Victoire ensuite 3-1 face au Deportivo La Corogne grâce à des buts de Raúl, Sergio Ramos et Ruud van Nistelrooy. Le Real conserve sa place de leader avant un déplacement à Saragosse, déplacement qu'il gère bien puisqu'il accroche un match nul décisif sur un doublé de van Nistelrooy (56ème, 1-1 ; 89ème, 2-2). Ce match permettra au club madrilène de rester 1er au classement de la Liga, avantage que le club gardera péniblement durant la dernière journée. Menés 1-0 à la mi-temps, les Merengues renversent la tendance grâce à José Antonio Reyes qui marque deux fois et Mahamadou Diarra et sont donc proclamés champions d'Espagne. Le 17 juin 2007, le Real remporte son 30e titre de Champion d'Espagne, en battant Majorque 3-1.
